為防止因使用不當造成電池過放電或者過充電，在鋰離子電池內設有三重保護機構。一是采用開關元件，當電池內的溫度上升時，它的阻值隨之上升，當溫度過高時，會自動停止供電;二是選擇適當的隔板材料，在溫度上升到一定數值時，自動溶解掉隔板上的微米級微孔，從而使鋰離子不能通過，電池內部反應停止;三是設置安全閥(就是電池頂部的放氣孔)，電池內部壓力上升到一定數值時，安全閥自動打開，保證電池的使用安全性。

有時，電池本身雖然有安全控制措施，但是因為某些原因造成控制失靈，缺少安全閥或者氣體來不及通過安全閥釋放，電池內壓便會急劇上升而引起爆炸。

隨著電池容量的新增，電池體積也在新增，其散熱性能變差，出事故的可能性將大幅新增。關于手機用鋰離子電池，基本要求是發生安全事故的概率要小于百萬分之一，這也是社會公眾所能接受的最低標準。而關于大容量鋰離子電池，特別是汽車等用大容量鋰離子電池，采用強制散熱尤為重要。

選擇更安全的電極材料，選擇錳酸鋰材料，在分子結構方面保證了在滿電狀態，正極的鋰離子已經完全嵌入到負極炭孔中，從根本上防止了枝晶的出現。同時錳酸鋰穩固的結構，使其氧化性能遠遠低于鈷酸鋰，分解溫度超過鈷酸鋰100℃，即使由于外力發生內部短路(針刺)，外部短路，過充電時，也完全能夠防止了由于析出金屬鋰引發燃燒、爆炸的危險。

提高現有安全控制技術的性能，首先要提高鋰離子電池芯的安全性能，這對大容量電池尤為重要。選擇熱關閉性能好的隔膜，隔膜的用途是在隔離電池正負極的同時，允許鋰離子的通過。當溫度升高時，在隔膜熔化前進行關閉，從而使內阻上升至2000歐姆，讓內部反應停止下來。